B
Tahun ketiga setelah STAIN Palopo beralih status menjadi IAIN yaitu tahun 1999, Jurusan Syariah STAIN Palopo berdiri, dengan program Studi Muamalah yang kemudian menjadi Ekonomi Islam. Pada tahun yang sama juga terbentuk Program Studi Hukum Perdata Islam.